يقوم الجهاز المناعي بإطلاق الهستامين والمواد الكيميائية الأخرى استجابة لبروتين حليب الأبقار ، وتحدث الأعراض عادة في غضون 20 إلى 30 دقيقة من تناول البروتين لكنها قد تظهر بعد ساعتين ، ومن الممكن أن تظهر الأعراض بشكل تدريجي من 48 ساعة إلى أسبوع بعد تناول بروتين حليب الأبقار .
لا ينبغي الخلط بين حساسية حليب الأبقار وعدم تحمل اللاكتوز ، وهي حالة لا يستطيع فيها الجسم إنتاج ما يكفي من الإنزيم اللازم لهضم نوع من السكر الموجود في الحليب .
إذا كنت تشك في أن الطفل مصاب بحساسية بروتين حليب الأبقار ، فحدد موعدًا مع الطبيب الذي سوف يسأل عن تاريخ عائلة الطفل لمعرفة ما إذا كان أفراد الأسرة الآخرون يعانون من الحساسية الغذائية أو الربو أو الأكزيما أو الحساسية ، كما سوف يرغب في معرفة كل شيء عن الأعراض ومتى ظهرت لأول مرة .
قبل تأكيد تشخيص حساسية حليب الأبقار ، قد تكون هناك حاجة إلى استبعاد الحالات الأخرى التي قد تسبب أعراضًا مماثلة مثل عدم تحمل الطعام والحساسية الغذائية الأخرى ومرض الاضطرابات الهضمية .